Может ли биолог починить радио? 20 лет спустя

Джерело:
Хабрахабр / Захабренные / Тематические / Посты

Дата публікації:
26/05/2023 12:22

Постійна адреса новини:
http://www.vsinovyny.com/10054012

Может ли биолог починить радио? 20 лет спустя

26/05/2023 12:22 // Хабрахабр / Захабренные / Тематические / Посты

В 2002 в журнале Cancer Cell вышла весьма саркастическая статья Юрия Лазебника «Может ли биолог починить радиоприемник, или что я понял, изучая апоптоз».

За 20 лет много изменилось. Биологи создали графический язык SBGN (Systems Biology Graphical Notation) для представления структуры биохимических путей и XML формат SBML (Systems Biology Markup Language) для представления математических моделей.

Кроме самих стандартов, необходимо программное обеспечение, которое их поддерживает. Начиная с 2001 года наша команда разрабатывает программный комплекс BioUML для моделирования сложных биологических систем и анализа биомедицинских данных. UML в его названии – это отсылка к стандарту UML – Unified Modeling Language, языку графического описания для объектного моделирования в области разработки программного обеспечения. Используя ПК BioUML, нашей группой были построены сложные компьютерные модели биологических систем (насколько я знаю, некоторые из них — наиболее сложные в мире для соответствующих систем).

Таким образом, современные стандарты SBGN и SBML и ПК BioUML позволяют биологам создавать схемы и модели биологических систем, вполне сопоставимые по уровню формализации с инженерными схемами.

» Читати повністю

«	Наступна новина з архіву ITSumma выпустила opensource-решение для описания и разворачивания инфраструктуры в Yandex Cloud одним yaml-файлом	Попередня новина з архіву Действительно ли Вселенная фундаментально нестабильна?	»